La densité de Neptune est encore plus grande que celle d'Uranus, 1,638 comparé à 1,30. Comme pour Uranus, on pense que le noyau de Neptune est fait de roches et de métaux et qu'il est entouré d'un manteau de glaces.
Le champ magnétique de Neptune est 27 fois plus intense que celui de la Terre. Comme celui d'Uranus, il est très penché, à 47° de l'axe de rotation, et décalé d'au moins 0,55 rayon du centre de la planète. Comme pour Uranus, on croit que ce champ est produit par de l'eau liquide en mouvement à l'intérieur de la planète.